A partire dal 13 Dicembre 2009 la tratta ferroviaria tra le stazioni di Varese e Porto Ceresio sarà chiusa a causa dei lavori per il nuovo collegamento Arcisate - Stabio (maggiori informazioni qua) e relativo raddoppio Varese - Arcisate.
Secondo il comunicato ufficiale i lavori dovrebbero terminare a Giugno 2012, nel frattempo sulla tratta interrotta sarà istituito un servizio sostitutivo con autobus.